内镜与肺功能亚专业，是国家呼吸与危重症专科医师（PCCM）内镜培训基地，拥有多功能操作间3间，模拟支气管镜1间，呼吸临床病理室1间，每年诊治患者超过5000人，拥有本专业相关得国际、国内最先进相关设备。

目前已开展：普通及无痛支气管镜、超声支气管镜（EBUS）、电磁导航、荧光支气管镜、内科胸腔镜、硬质气管镜、气道腔内肿瘤切除、激光消融术、光动力治疗、氩等离子凝固术、冷冻肺活检及治疗、气道内药物治疗、经支气管镜活瓣肺减容术及封堵术、支气管热成型术、快速现场细胞学评价技术(ROSE)等。

现肺部结节精准化诊疗专科特色就是利用超声支气管镜、电磁导航技术，对肺部结节进行精准定位引导活检，结合快速现场细胞学评价技术(ROSE)，提高早期肺癌的诊断率。联合胸外科、放射科、病理科、微生物室等科室，通过MDT形式成立多学科协作临床诊治平台，为肺部疾病患者提供一站式多学科联合管理模式，为呼吸系统疾病的精准诊疗提供了强大的技术支持。